雖然外商代表處無法直接進行商務活動，進而沒有收入，但是他們仍然有納稅申報和支付的責任。
一．營業稅&企業所得稅
根據國家稅務局，國稅發[2003]28號，外商代表處計算應納稅額共有三種方式。
（1）按實納稅（查賬征收）
計算公式：
應納營業稅款=傭金、手續費收入×5％
應納企業所得稅款=(收入－成本費用)×33％(分30％和3％)
適用對象：
對國稅發[1996]165號第一條第一款第2項列舉的從事商務、法律、稅務、會計、審計等各類咨詢服務性的代表機構，必須建立健全會計賬簿，正確計算收入和應納稅所得額，據實申報納稅。
（2）按經費支出額均衡換算收入額納稅（成本附加法）
如果外國代表處已參與了涉稅業務，但無法正確核算其收入情況下，則按相應的支出換算相應收入額依法進行納稅申報并計算征收各稅。應納各稅計算方法，按(85)財稅外字第200號文件規定，核定利潤率1O％，營業稅稅率5％。
計算公式：
應納營業稅=本期經費支出額÷(1-10％-5％)×5％
應納企業所得稅=本期經費支出額÷(1-10％-5％)×10％×33％
適用對象：
對國稅發[1996]165號第一條第一款第1、4、5項列舉的從事各項貿易、代理服務，廣告，旅行社等各類服務性代表機構，考慮到此類代表機構從事的各項業務，主要是依照其總機構的要求開展的，沒有直接與接受服務者簽訂合同或協議，其提供服務應歸屬于該代表機構的收入，通常由其總機構統一收取。對此類代表機構統一采取按經費支出換算收入的辦法確定收入，并據以征稅。最常見的基礎是按經費支出額均衡換算收入額納稅的方式。
（3）按實際取得的收入核定利潤率納稅
計算公式：
應納營業稅款=收入×適用稅率
應納企業所得稅款=收入×10％×33％
適用對象：
國稅發[1996]165號第一條第一款規定的除上述兩類以外從事應稅業務的代表機構，可根據其從事經營活動實際取得的業務收入(包括由其總機構統一收取的)，按期向當地主管稅務機關申報納稅；稅務機關進一步明確了應稅項目和非應稅項目。凡當年度內沒有取得業務收入的，可在年度終了后的一個月內，申報其年度經營情況。
稅收免征項目：
凡是由外國政府，國際組織，非營利機構或者民間組織設立的外商代表處有權申請免稅。
二．個人所得稅
首席代表和總代表應該向稅務機關按月申報個人所得稅。無論收入是否來源于中國境內，都需要向稅務機關提交由總部出具的月收入確認書。稅務機關不接受外商代表在中國零收入。
計算公式：
應納稅所得額=月工薪-1000元-附加費用（3200元）-其它項目支出
應納個人所得稅=應納稅所得額×適用稅率-速算扣除數

個人所得稅稅目稅率
（適用于工資薪金所得）
級 數 全 月 應 納 稅 所 得 額 稅 率 速 扣
第一級 500元以下 5% 0
第二級 500-2000元 10% 25
第三級 2000-5000元 15% 125
第四級 5000-20000元 20% 375
第五級 20000-40000元 25% 1375
第六級 40000-60000元 30% 3375
第七級 60000-80000元 35% 6375
第八級 80000-100000元 40% 10375
第九級 100000元以上 45% 15375

稅收減免
下列項目免收個人所得稅：
在中國工作的外交機構（包括大使，部長，事務負責人等外交官頭銜的領事館工作人員），領事和大使館的工作人員來源于中國境內的所得，根據中國相關法律免征所得稅。
下列項目暫免個人所得稅：
1． 符合國家規定的外籍專家（如按照世界銀行貸款協議又該行直接派往中國工作者，聯合國組織直接派往中國工作者，援助國派往中國轉為該國無償援助項目工作者，某些來華工作而工資、薪金由外方負擔的專家等）的工資、薪金所得。
2． 外國人以非現金形式或者實報實銷形式取得的住房補貼，伙食補貼，搬遷費，洗衣費，按照合理的標準取得的出差補貼，取得的探親費，語言訓練費，子女教育費，從外商投資企業取得的股息、紅利。